Newsletter · 2026-06-25 · Ashutosh Agarwal

BIO 2026で物理ベース創薬スクリーニングが躍進、AlphaFoldの生みの親ジョン・ジャンパーがAnthropicへ

AI drug discovery newsletter for the week of June 19 to 25, 2026. BIO 2026 elevated physics-based virtual screening (Sandbox AQ with NVIDIA BioNeMo) over language models, AlphaFold architect John Jumper left DeepMind for Anthropic, and Eli Lilly dominated the deal tape while pure-play techbio names stayed quiet.

AI創薬ウィークリー

2026年6月25日号：BIO 2026で物理ベース創薬スクリーニングが躍進、AlphaFoldの生みの親ジョン・ジャンパーがAnthropicへ

TL;DR

• 今週の焦点はサンディエゴで開催されたBIO 2026。Sandbox AQがNVIDIA BioNeMoとの物理ベース・バーチャルスクリーニング提携を発表し、より大きな議論として「創薬は言語モデルから脱却すべきだ」という主張が会場を席巻した。
• ジョン・ジャンパー氏、AlphaFoldを生み出したノーベル賞受賞者がDeepMindを離れAnthropicへ移籍し、AlphaFoldを「汎用的な生物学AGI」ではなく「狭い領域に特化した工学的予測モデル」と再定義する異例のインタビューに応じた。
• **イーライリリー(LLY)**が今週の取引案件を席巻。Abbiskoとの19億ドルの研究提携、78億ドルのCentessa買収の完了、破綻したSangamoのゲノム編集プラットフォームへのスターキングホース入札、BioArcticとの神経疾患提携、そして次世代肥満症治療薬レディトルチドをめぐる物議を醸す単一患者向けコンパッショネートユース(人道的使用)プログラムなど。
• 純粋なAIテックバイオ銘柄(RXRX、SDGR)は静かで、今週は企業固有のポッドキャストやニュースフローはなかったが、ヘルスケア小型株への資金流入を受けて両銘柄とも株価は上昇した。

今週のトピック

物理ベース・スクリーニングがBIOで主流に。 Sandbox AQのCEOジャック・ヒッテリー氏は会場からライブで発表し、製薬企業が「バイオファーマ市場向けにNVIDIAが提供する非常に強力なプラットフォームであるBioNeMoと、AQ Stateを組み合わせて」使うことで、OzempicやMounjaroと同じ受容体クラスであるGPCR標的リガンドをスクリーニングし、「数年から数十年」かかっていた開発期間を「数週間から数ヶ月」に圧縮できると語った(Squawk on the Street、6月23日)。ヒッテリー氏は「FDAに申請される新薬の30%以上がこの標的にフォーカスしている」と指摘し、同ツールは結合の有無だけでなく、アゴニストかアンタゴニストかという作用機序まで予測できるとした。

AlphaFoldの生みの親がAnthropicへ。 Machine Learning Street Talk(6月22日)にて、ジョン・ジャンパー氏は移籍を認めた上で、AlphaFoldを汎用基盤モデルとみなす見方に反論した。「人々がビター・レッスン(苦い教訓)を適用しようとするやり方には、あまり共感できない。実際、AlphaFold 2はその真逆なんです」。同氏はAlphaFold 3の低分子化合物への拡張を創薬へつなぐ架け橋と位置づけ、「今なら、この薬がまさにここに結合する、と言えるようになった」と述べた。これはIsomorphic Labsが創薬プログラムを構築する土台でもある。

まれに見る検証済みAI標的ベンチマーク。 Verge GenomicsのCEOアリス・チャン氏は、同社のALS(筋萎縮性側索硬化症)提携において、AI由来標的の83%がリリーのウェットラボ実験で検証されたことを明らかにした。これはリリー自身が成功基準とした20%を大きく上回る数字で、2つの標的がリリーの社内パイプラインへオプション行使された(This Week in Startups、6月22日)。同氏はテックバイオの取引モデルについて具体的な数字を示した。「契約一時金が2500万から4200万ドル…マイルストーンの合計は各契約で7億から8億ドルほど」と、リリー、そしてアストラゼネカのAlexionとの契約に言及した。

リリーのAI戦略、内側から。 SVPのマヒ・リアッサム氏は「過去12ヶ月で目にしたイノベーションの量は、それ以前の10年間で見たものを上回っている」と語り、3つのフィルターからなるフレームワークを説明した。まず患者へのインパクトとROIを優先すること、次に「AIが最適なツールとは言えない」領域について正直であること、そして単なる自動化ではなく「ワークフローを再構築する」ことだ(Transform NOW、6月23日)。注目すべきは、「AIを信頼せよ」という枠組みを同氏が否定した点だ。「私たちは科学者に『AIを信頼しろ』とは言っていません…AIは他のツールと同じく、あくまでツールの一つです」。

論点

物理モデル対言語モデル。 これが今週最大の生きた緊張関係だった。ヒッテリー氏は率直だった。「医学における最大の課題に取り組むには、言語モデルを超えていく必要がある…求められているのは物理ベースのモデルだ」(Squawk on the Street、6月23日)。ジャンパー氏の見解はこれと相補的でありながら異なる。勝つのは汎用モデルではなく、狭い領域に特化したスペシャリスト型予測モデルかもしれないという見立てだ。AlphaFoldは「自然科学レベルの予測を、ボタン一つで、しかし非常に狭いカテゴリーの中で実現している」(MLST、6月22日)。投資的な含意としては、LLMを単純にスケールさせて生物学へ適用する道筋への懐疑論がある。

生物学でスケーリングは本当に効くのか。 チャン氏はテキストAIのスケーリング神話に真正面から異を唱えた。「私たちがこれまで目にしてきた最大の成果は、実はデータとモダリティのスケーリングから来ている…重要なのはAIを大きくすることではなく、正しいペアのデータを与えることだ」(TWiS、6月22日)。同氏の「LIDAR対カメラ」の比喩、独自の脳組織を「疾患の分子レベルのグラウンドトゥルース」と位置づけるくだりは、競争優位の源泉を計算力ではなくデータのモダリティに置き換えるものだ。

肥満治療におけるアクセスの公平性。 The Readout Loud(6月25日)にて、STATのリジー・ローレンス氏は、リリーとFDAが「有力なコネを持つ」79歳の患者一人に対し、コンパッショネートユースの枠組みでレディトルチドへの静かなアクセスを認めた経緯を詳報した。この件は「高官レベルの関心」を集めており、「通常はあり得ないこと」だという。肥満治療の専門家であるアンジェラ・フィッチ医師は「これが該当しうる患者は4000万人もいる」と反論し、自身がリリーに問い合わせても返答はなかったと述べた。

注目銘柄

イーライリリー(LLY)は今週、取引案件を量産した企業だった。Abbisko Therapeuticsとの19億ドルの研究提携(6月24日)を締結し、78億ドルのCentessa買収を1株38ドル+最大9ドル相当のCVR(条件付き価値権)付きで完了(6月24日)。さらに破綻したSangamo Therapeuticsのゲノム編集プラットフォームとプリオン病プログラムに対するスターキングホース入札を取り付けた(6月23日)。これはリリーが遺伝子編集能力を割安に取り込もうとしているサインとも読める。またBioArcticとのBrainTransporter神経疾患提携(契約一時金3000万ドル、マイルストーン最大7億7000万ドル、6月22日)も締結した。セルサイドもこれに追随し、リーリンクは目標株価を1,232ドル(アウトパフォーム)に、ベレンベルグは1,135ドル(ホールド)に引き上げた。患者アクセス面では、リリーはメディケアGLP-1ブリッジプログラム(対象となるPart D患者向けに月額50ドル、7月1日発効)の詳細を発表した。

**シュレディンガー(SDGR)とリカージョン(RXRX)**は今週、企業固有のポッドキャストやニュースフローがなかった。両銘柄とも(SDGR +5.3%、RXRX +3.4%)、テック株主導の下落後にヘルスケア小型株へ資金がローテーションする流れに乗って上昇した。RXRXは株価3.34ドルと52週安値(2.77ドル)のすぐ上に位置しており、時価総額はBIOで見られたAIテックバイオへの盛り上がりに比べると見劣りする。プラットフォームの物語と公開市場での評価とのギャップが広がりつつあり、注視に値する。

波及効果

• **NVIDIA(NVDA)**はBioNeMoのバイオファーマ領域への浸透をさらに広げている。Sandbox AQとの提携は、GPUネイティブかつ物理ベースの創薬が「実験」ではなく「インフラ」になりつつあることを示すもう一つの証拠だ。
• Alphabet(GOOGL)/Isomorphic Labsは、AlphaFold 3の低分子化合物対応が実際の創薬設計へと近づくことで概念的な恩恵を受ける一方、ジャンパー氏のAnthropicへの移籍は静かな人材流出リスクへの疑問を投げかけている。
• Anthropicは今や構造的な科学AIのプレイヤーとなった。ジャンパー氏の招聘は、汎用チャットモデルにとどまらず、工学的な生物学予測へと野心を広げていることを示している。
• エコシステムの買い手としてのリリー: Abbisko、Centessa、Sangamo、BioArctic、そしてAbSci(1億ドルの資金調達ラウンド)への一連の動きは、LLYがAI創薬能力とGLP-1関連の周辺領域の両方を統合しつつあることを示しており、検証済み標的を供給できるテックバイオ・プラットフォームにとって安定した需要の受け皿となっている。

先週からの変化

今週のベースラインとして、物理ベース・スクリーニング(NVIDIAと組んだSandbox AQ)と、狭い領域に特化したAlphaFold系譜のモデルが技術面の支配的なナラティブであり続けている。リリーは最も活発な戦略的買い手であり、純粋な公開テックバイオ銘柄(RXRX、SDGR)は、非公開市場やカンファレンスでの盛り上がりに比べると依然として静かで、評価は相対的に切り下がったままだ。